打孔时间一般在播种后3-5天进行，当菌丝变白萌发，并开始向培养料延伸时打孔。如果打孔过早，菌丝还未萌动，易污染杂菌；打孔过晚，菌丝在发育期缺氧，会影响菌丝的生长发育。

　　打孔部位:应严格控制在菌种层上或菌丝延伸处。尤其是菌种用量少、菌丝延伸慢时，更不能在菌袋上到处乱打孔，以免引起杂菌污染和虫害。

　　打孔的大小和数量:打孔时用大针头即可（在筷子上绑3-4根大针头）。每次每袋围绕发菌层打10-12个孔，以后随着菌丝的发育和延伸，每5-7天打一次孔，整个发菌期打孔3次即可。